市面上銷售的電泳儀電源，按電壓分為高壓1500～5000V、中壓500～1500V、低壓500V以下三種；按電流分為大電流500mA～2000mA、中電流100～500mA、小電流100mA以下三種；按功率分為大功率200～400W、中功率60～200W、小功率60W以下三種。
從電壓的角度來看，用于核酸（瓊脂糖）水平電泳、PCR電泳、DNA回收、印跡轉移等實驗只需較為高電壓300V；用于蛋白垂直電泳、種子純度電泳、醋酸纖維膜電泳等需要使用較為高電壓600V左右的電泳儀；用于DNA測序（SSR分子標記）、等點聚焦電泳、雙向電泳等要求較為高電壓3000V；用于DNA測序電泳（AFLP分子標記）要求較為高電壓3800V。
輸出的所有參數根據其型號的不同都有一個特定的工作范圍，如果實際需要*過這一范圍，就應當選擇能夠滿足使用的另外型號的電泳儀電源。因為高、低壓電泳儀內部結構特征不同，由于高壓電泳儀常附加著多功能，而且高壓電泳儀決不能空載運行（容易造成人身傷害內部器件損壞），導致操作上難易程度的不同等。因此，選用合適規格的電泳儀很重要。
用戶如果需要一臺電泳儀電源帶幾個電泳槽工作時，首先要確定總電流不要*過儀器的較為大范圍，其次各電泳儀之間是并聯的，因而每個電泳儀的電壓都是相同的，總電流為各電泳儀電流之和。使用時注意不能*出電泳儀電源額定的范圍。
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